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氫氣醫學效應是最近才發現的，具體說是2007年才被日本學者發現的。更嚴格說，1975年就有美國科學家證明了高壓氫氣具有治療皮膚癌癥的作用，距今也有45年了，所以氫氣醫學效應的發現并不是最近才發現。這個問題更準確的表達也許是，小劑量氫氣的醫學效應為什么最近才被發現。
這個問題背后的真正含義是，那么多聰明的大牛學者，氫氣又是比較重要的氣體，也是被充分研究的氣體，為什么就沒有人發現其醫學效應。所以說，這個問題對氫氣醫學效應是否真實的另外一種表達方法。
嚴格意義上，即使小劑量氫氣的效應也不是最近才發現，如果把電解水效應算上，60年前就有人證明電解水的作用，今天我們已經證明電解水的作用基礎主要就是因為含有氫氣。2007年只是證明這種效應的基礎是氫氣的作用，所以這種作用或現象早就被人開始研究，只是沒有找到正確的答案。電解水會產生氫氣，而具有疾病治療作用的電解水恰好是產生氫氣的陰極，為什么早期研究忽視了氫氣？我認為有兩個原因，一是氫氣是相對比較惰性的氣體，其活性似乎不足以能產生生物效應，二是氫氣非常難溶解于水，電解過程氫氣大部分以氣泡形式釋放出來。估計活性小，推測劑量低，這可能是被長期忽視的原因。特別詭異的是，1997年著名電解水研究學者白鈿教授對電解水具有抗氧化作用的研究中，采用氫氣溶解水作為對照，竟然沒有發現氫氣的效應。這是非常令人遺憾的。
1975年高壓氫氣治療癌癥的研究，雖然本質上是氫氣的醫學作用，但這種作用需要的高壓氫氣條件，是很難被臨床醫學應用接受的方法，不僅操作困難，而且非常危險。所以這個研究不僅不利于氫氣醫學效應的發現，可能對后來的研究產生負面作用，既然沒有應用價值，且研究條件要求高，又有很大風險，這樣的研究就沒什么研究意思了。
氫氣是一種典型的生物學氣體，在高等生物系統的地位比較低可能是被忽視的原因。說一種物質是一種生物分子，是根據這種物質是生物能制造，并對生物產生一定影響的物質。多種多樣的代謝物也是典型的生物分子。例如各種有機物，如蛋白質、核酸、糖、小肽、氨基酸、核苷酸、各種有機酸，生物體內產生的生物分子是一個十分龐大的群體。代謝組學是一種專門研究代謝分子的研究工具。采用組學方法研究也說明代謝物的復雜性，人們很難對單個分子進行全面的功能解析，還存在大量生物分子的功能不被人們了解。氫氣雖然被深入研究，但是這種分子由于分子體積小，擴散能力強，一般的研究方法很難保證準確分析，如果不進行專門研究，甚至識別和分析都很困難。這也見于其他生物氣體分子，例如一氧化氮研究首先發現“來自血管內皮細胞能擴張血管活性的物質”，許多年后才追蹤到一氧化氮分子是產生這種效應的基礎。對一氧化碳和硫化氫的研究則主要是參考了一氧化氮的研究主動去尋找的。這些生物分子的發現也都是比較晚近的事，而這些氣體相對比氫氣更容易發現。一是這些經典氣體分子的生理功能強，例如一氧化氮是血壓、免疫和神經系統功能的基本調節分子，正常生理功能不能離開這些分子的存在。許多細菌能合成氫氣，也有細菌能利用氫氣。至少在細菌層面，氫氣也是典型的生物氣體。不過氫氣的生物學地位沒有達到上述生物氣體的境界，至少目前都未發現氫氣對生物體不可或缺的生理功能。所以長期被忽視的一個重要原因是氫氣生物學地位比較低。
從生物進化角度，氫氣有比較高的生物地位，例如氫原子是組成有機物基本成分，氫氣是復雜生物分子進化的關鍵原料，氫氣對真核生物的進化也可能具有重要作用。今天的低等生物，氫氣仍然具有代謝核心地位，許多原生生物都具有合成氫氣的能力，也有許多低等生物具有利用氫氣的能力。其中比較典型的就是多種生物包括人類的腸道內細菌，不僅存在大量能合成氫氣的細菌，也有多種能利用氫氣的細菌如產甲烷菌和硫化菌。對氫氣代謝的研究，學術界比較重視的是生物制氫技術的研究，但這些研究主要考慮把氫氣作為能源看待，沒有從生物學意義上考慮氫氣的作用。
